AC protein-phylogeny
Комплексный рабочий процесс филогенетического анализа семейств белков с контролем качества, анализом консервативности, анализом сетей коэволюции и визуализацией, готовой для публикации. Используйте при: (1) анализе эволюции семейств белков, (2) построении филогенетических деревьев по последовательностям, (3) идентификации консервативных/коэволюционирующих остатков, (4) создании фигур и отчетов для публикации, (5) контроле качества наборов данных последовательностей или (6) проведении систематического эволюционного анализа семейств ферментов, суперсемейств белков или любых групп гомологичных белков.
машинный переводПоказать оригиналСкрыть оригинал«Comprehensive protein family phylogenetic analysis workflow with quali…»
Comprehensive protein family phylogenetic analysis workflow with quality control, conservation analysis, coevolution network analysis, and publication-ready visualization. Use when: (1) analyzing protein family evolution, (2) building phylogenetic trees from sequences, (3) identifying conserved/coevolved residues, (4) generating publication-quality figures and reports, (5) quality-controlling sequence datasets, or (6) performing systematic evolutionary analysis of enzyme families, protein superfamilies, or any homologous protein groups.
Комплексный рабочий процесс филогенетического анализа семейств белков с контролем качества, анализом консервативности, анализом сетей коэволюции и…
Как процесс C 53/100 · Есть пробелы — слабые места: результат и критерий готовности, когда включается, входы и предусловия
Чем это грозит
Находки средней серьёзности: скорее всего скилл честный, но прочитайте, что именно насторожило сканер.
Ниже описан худший случай для этой категории. Здесь находка средней серьёзности: guard увидел признак, но не доказательство.
Скилл содержит команды, которые удаляют файлы, переписывают диски или исполняют код, скачанный из сети. Агент может выполнить их без вопроса, если считает, что так требует инструкция.
Замените разрушительные команды на безопасные аналоги с подтверждением, ограничьте область действия конкретной папкой и не тяните код через curl | bash: укажите версию и контрольную сумму.
Как улучшить
- Свои кейсы (evals/evals.json, 4–6 реальных запросов с ожидаемыми ответами): тогда полная проверка прогонит именно их, а не черновик от модели.
- spec.yaml с триггерными фразами и утверждениями — контракт поведения для CI; `skilltest init` создаст шаблон.
Находки guard · 3
✓ Критических и высоких находок нет
Средние и низкие: 3
-
средняя Опасные команды
cmd-privilegescripts/install_dependencies.sh:115Повышение привилегий / права на запись для всехsudo cp iqtr…nux/bin/iqtree2 /usr/local/bin/ || cp iqtr…nux/bin/iqtree2 ~/.local/bin/
-
средняя Опасные команды
cmd-privilegescripts/install_dependencies.sh:121Повышение привилегий / права на запись для всехsudo cp iqtr…OSX/bin/iqtree2 /usr/local/bin/ || cp iqtr…OSX/bin/iqtree2 ~/.local/bin/
-
низкая Опасные команды
cmd-privilegeTESTING.md:343Повышение привилегий / права на запись для всех (тестовый файл / пример)sudo cp iqtr…nux/bin/iqtree2 /usr/local/bin/
тестовый файл
Просканировано файлов: 21. Улики замаскированы. Пометки в серых чипах объясняют, почему серьёзность понижена.
По спецификации Agent Skills
✓ По спецификации Agent Skills замечаний нет
Процессный рейтинг: все десять параметров 53/100
- 0Результат и критерий готовности. Не сказано, что считать результатом
- 0Входы и предусловия. Не сказано, что нужно иметь на входе
- 0Отчётность по ходу. Скилл ничего не сообщает по ходу работы
- 20Когда включается. Не сказано, при каком запросе скилл включается
- 30Повторный запуск. Изменяющих операций: 5, без проверки текущего состояния
- 60Инструменты и файлы. Используются инструменты (python), но во frontmatter они не объявлены
- 100Шаги. Шагов: 94
- 100Ошибки и развилки. Развилок: 1, есть раздел про ошибки
- 100Согласованность. Имя и обязательные поля на месте
- 100Стоимость исполнения. Тело инструкции 1910 токенов
- low Разделов верхнего уровня: 10. Похоже на несколько доменов в одном скилле
Всё перечисленное измерено по тексту скилла, а не оценено моделью: цифры проверяемы. Вес параметра тем больше, чем чаще из-за него процесс встаёт.
Сигналы качества
- +5В description нет примеров фраз, по которым скилл должен срабатывать
- +4Описание не говорит, когда скилл НЕ применять (ложные срабатывания)
- +3Формат ответа не описан: модель каждый раз решает сама
- +1Лицензия не указана
- +2Инструкции на одном языке
- +3Длина description 542 символов: достаточно сигнала, не съедает бюджет
- +4Структура: 27 заголовков
- +3Пошаговые инструкции: 94 пунктов
- +4Есть примеры (4 блоков кода)
- +4Справочные файлы упоминаются в инструкциях (6 из 7)
- +3Все 8 скриптов описаны в инструкциях
База качества 70; замечания lint вычитаются, сигналы прибавляют до 100. Итог: 91.