AF protein-ligand-docking
Запускает рабочий процесс стыковки белка-лиганда для исследовательских вопросов о связывании мишени, селективности и структурной правдоподобности. Используйте этот навык, когда пользователь спрашивает, может ли лиганд связываться с белковой мишенью, хочет сравнить стыковку между видами или гомологами, или нуждается в пошаговом вычислительном рабочем процессе, который использует извлечение последовательности, поиск структуры, AlphaFold/Colab и AutoDock Vina.
машинный переводПоказать оригиналСкрыть оригинал«Run a protein-ligand docking workflow for research questions about tar…»
Run a protein-ligand docking workflow for research questions about target binding, selectivity, and structural plausibility. Use this skill when the user asks whether a ligand may bind a protein target, wants a docking-oriented comparison across species or homologs, or needs a stepwise in silico workflow that uses sequence retrieval, structure search, AlphaFold/Colab, and AutoDock Vina.
Запускает рабочий процесс стыковки белка-лиганда для исследовательских вопросов о связывании мишени, селективности и структурной правдоподобности.
Как процесс F 58/100 · Не запустится — Скилл ссылается на файлы, которых нет в архиве: references/alphafold_multimer_colab.ipynb
Как улучшить
- В тексте есть ссылки на отсутствующие файлы: добавьте файлы или уберите ссылки.
- Свои кейсы (evals/evals.json, 4–6 реальных запросов с ожидаемыми ответами): тогда полная проверка прогонит именно их, а не черновик от модели.
- spec.yaml с триггерными фразами и утверждениями — контракт поведения для CI; `skilltest init` создаст шаблон.
Находки guard · 0
✓ Критических и высоких находок нет
Просканировано файлов: 8. Улики замаскированы. Пометки в серых чипах объясняют, почему серьёзность понижена.
По спецификации Agent Skills
- предупреждение
missing-refссылка на отсутствующий файл: references/alphafold_multimer_colab.ipynb
Процессный рейтинг: все десять параметров 58/100
- 0Инструменты и файлы. Не хватает 1 файла(ов): references/alphafold_multimer_colab.ipynb
- 0Результат и критерий готовности. Не сказано, что считать результатом
- 70Когда включается. Сказано, когда применять, но не сказано, когда не стоит
- 70Входы и предусловия. Входные данные и предусловия перечислены
- 70Ошибки и развилки. Развилок: 4
- 100Шаги. Шагов: 53
- 100Согласованность. Имя и обязательные поля на месте
- 100Стоимость исполнения. Тело инструкции 1271 токенов
- 100Повторный запуск. Изменяющих операций нет
- 100Отчётность по ходу. Скилл сообщает о ходе работы
Всё перечисленное измерено по тексту скилла, а не оценено моделью: цифры проверяемы. Вес параметра тем больше, чем чаще из-за него процесс встаёт.
Сигналы качества
- +5В description нет примеров фраз, по которым скилл должен срабатывать
- +4Описание не говорит, когда скилл НЕ применять (ложные срабатывания)
- +3Формат ответа не описан: модель каждый раз решает сама
- +4Нет примеров входа/выхода
- +1Лицензия не указана
- +2Инструкции на одном языке
- +3Длина description 390 символов: достаточно сигнала, не съедает бюджет
- +4Структура: 14 заголовков
- +3Пошаговые инструкции: 53 пунктов
- +4Справочные файлы упоминаются в инструкциях (1 из 1)
- +3Все 4 скриптов описаны в инструкциях
База качества 70; замечания lint вычитаются, сигналы прибавляют до 100. Итог: 81.